Эпидемиология и Инфекционные болезни. Актуальные вопросы №3 / 2020
Генетическая характеристика ВИЧ-1 у пациентов с опытом вирусологической неудачи терапии в Киргизской Республике в 2017–2018 гг.
1) ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва, Россия;
2) Республиканский Центр СПИД Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Бишкек, Киргизия;
3) Ошский областной Центр профилактики и борьбы со СПИДом Министерства здравоохранения Киргизской Республики, Ош, Киргизия
Цель исследования. Молекулярно-генетический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в Киргизии в 2017–2018 гг. среди пациентов с неудачным опытом антиретровирусной терапии.
Материалы и методы. Была собрана коллекция образцов плазмы крови (n =100), исследованы нуклеотидные последовательности гена pol ВИЧ-1, определены субтиповая принадлежность вируса в образцах, структура и уровень лекарственной устойчивости ВИЧ-1.
Результаты. Установлено доминирование в Киргизии рекомбинантного варианта ВИЧ-1 CRF63_02A1 (в 56% образцов), и суб-субтипа A6 (в 41% образцов). В то же время выявлены случаи инфицирования редкой генетической формой ВИЧ-1, близкой к CRF94_cpx и CRF95_02B, и высокая частота мутаций устойчивости к препаратам, входящим в основные применяемые в стране схемы терапии: к EFV и NVP (в 48 и 50% образцов соответственно) и к FTC и 3TC (в 39% образцов).
Заключение. Выявленная высокая частота лекарственной устойчивости к препаратам, составляющим основные схемы АРТ, у пациентов с высокой приверженностью лечению говорит о необходимости дальнейшего мониторинга лекарственной устойчивости в стране, в том числе среди пациентов без опыта терапии и только приступающих к ней.
По данным ЮНЭДС, общее число больных ВИЧ-инфекцией в Киргизской Республике в 2018 г. составляло примерно 8500 человек (6500–12 000) [1]. Предыдущее исследование образцов, собранных в 2009–2010 гг. от 57 пациентов без опыта терапии, выявило, что 45,6 и 40,4% из них содержали соответственно вирусы генетических вариантов CRF02_AG и A1 (вариант IDU-A). Кроме того, около 7% исследованных образцов ВИЧ-1 имели мутации устойчивости к препаратам классов НИОТ и ННИОТ [2].
Однако с 2015 г. номенклатура ВИЧ-1 и методика интерпретации результатов генотипирования (в том числе алгоритм автоматического определения генотипа в онлайн приложениях) были значительным образом пересмотрены. В частности, генетическому варианту, именуемому ранее IDU-A (FSU-A), было присвоено наименование «суб-субтипа A6» [3, 4]. Кроме того, детально описанный в 2014 г. рекомбинантный вариант CRF63_02A1 [5] был выявлен в образцах ВИЧ-1 из России, в том числе у пациентов, вирус в организме которых ранее был интерпретирован как CRF02_AG [6]. Более того, недавнее исследование позволило установить наиболее вероятное место и время генерации CRF63_02A1 – Узбекистан, примерно 1996 г. [7]. Это может служить объяснением активного распространения данного варианта в странах Средней Азии.
Таким образом, существует необходимость в актуализации информации о циркуляции генетических вариантов ВИЧ-1 в Киргизии с учетом всех накопленных знаний об их особенностях.
Помимо Бишкека, столицы Киргизии, вторым городом республиканского значения является Ош, административный центр Ошской области. Ошская область находится в Ферганской долине и ввиду своего географического положения граничит одновременно с тремя государствами региона: Таджикистаном, Узбекистаном и Китаем. Это исторически ставило область в исключительное экономическое положение, делая ее частью крупнейших торговых маршрутов. Таким образом, экономическое и политическое влияние Оша исторически велико. В частности, в 1962–1970 гг. в состав Ошской области Киргизской АССР входила территория современных Джалал-Абадской и Баткенской областей [8], так что Ошская область занимала почти половину территории страны. К несчастью, наряду с торговыми потоками через Ошскую область проходит один из основных путей наркотрафика из Таджикистана в Казахстан и Россию [2, 9]. Проведенное ранее исследование генетических вариантов ВИЧ-1 в образцах из различных административных центров Казахстана [9] и России [6] показало, что распределение вариантов ВИЧ-1 в отдельных регионах каждой страны может сильно отличаться от общей статистики по стране в целом. Во многом это объясняется географическим положением данных административных центров, их взаимодействием с соседними государствами и национальным составом проживающего на территории населения.
По этой причине при изучении распространения ВИЧ-инфекции в Киргизии стоит обращать внимание на возможные особенности эпидемии в разных регионах страны. Ранее при сравнении вариантов ВИЧ-1, циркулировавших на территории соседних Чуйской и Джалал-Абадской областей, была отмечена экстремально высокая частота выявления уникальных рекомбинантных AG-форм в Джалал-Абадской области (41,8%) по сравнению с Чуйской областью (3,7%) [10].
В рамках осуществления глобал...
