Терапия №1 (11) / 2017
Метагеномный анализ состава орофарингеальной микробиоты при различных фенотипах хронической обструктивной болезни легких
1 ФГБОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова», г. Москва
2 ФГБОУ ВО «Сибирский государственный медицинский университет», г. Томск
3 ФГБОУ ВО «Московский государственный медико-стоматологический университет им. А.И. Евдокимова», г. Москва
4 ФГБОУ ВО «Российский национальный исследовательский медицинский универститет им. Н.И. Пирогова», г. Москва
Обоснование. Хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ) – заболевание легких, характеризующееся стойким, прогрессирующим ограничением скорости воздушного потока в ответ на действие патогенных частиц и прежде всего микрорганизмов. Данные опубликованных исследований свидетельствуют о том, что изолированный показатель ОФВ1 не в полной мере соотносится с клинической тяжестью заболевания, поэтому авторы рассматривали значение микробиоты для течения ХОБЛ с точки зрения различных фенотипов. Цель. Охарактеризовать особенности таксономического состава орофарингеальной микробиоты у пациентов с различными клинико-функциональными особенностями течения ХОБЛ. Материалы и методы. В исследование были включены 98 пациентов. Протокол исследования предусматривал 2 визита, включавшие сбор анамнеза и проведение клинико-функционального обследования. Забор орофарингеальных мазков проводился во время первого визита. Все полученные образцы подвергнуты секвенированию по последовательностям 16S рРНК. Для нахождения таксономических различий между группами образцов использован метод, основанный на линейном регрессионном анализе и скорректированный под метагеномные данные. Для улавливания значимых трендов в изменении микробиоты под влиянием частоты обострений и степени выраженности одышки использована обобщенная линейная модель. Результаты. Полученные данные продемонстрировали ряд существенных отличий в соотношении различных представителей микробиоты дыхательных путей в зависимости от клинико-функциональных особенностей течения заболевания, включая частоту обострений, выраженность одышки и фенотип ХОБЛ.
Хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ) – хроническое воспалительное заболевание легких, характеризующееся стойким, прогрессирующим ограничением скорости воздушного потока, связанным с повышенным воспалительным ответом легких на действие патогенных частиц и газов (GOLD, 2017) [1]. В настоящее время в традиционной классификации степени тяжести бронхообструкции у пациентов с ХОБЛ в качестве маркера используется объем формированного выдоха за 1-ю с (ОФВ1). Однако, как показано в некоторых исследованиях, он не имеет самостоятельного прогностического значения в отношении тяжести течения ХОБЛ [2, 3]. Поэтому в классификации GOLD (2014) в качестве показателей, определяющих гетерогенность течения ХОБЛ, наряду с ОФВ1 дополнительно использованы оценка выраженности одышки по опросникам mMRC или CAT и частота обострений заболевания в течение 12 мес [1]. Представленные подходы также не учитывают в полной мере всю совокупность индивидуальных особенностей клинико-функциональной характеристики пациента с ХОБЛ [3, 5]. Учеными была также предпринята попытка введения в клиническую практику понятия «фенотип» в качестве персонифицированного критерия для характеристики гетерогенности заболевания, степени тяжести и динамики его течения [6]. Но в этих классификационных подходах не учитывается роль микробиотических сообществ респираторного тракта, тогда как, по данным многочисленных исследований, бактериальные и вирусные инфекции вносят важный вклад в патогенез ХОБЛ [7, 8]. Бактериальная колонизация дыхательных путей влияет на характер и прогноз течения заболевания, а состав респираторной микробиоты – на терапевтический подход к ведению этих больных [9–12]. Однако работ, посвященных изучению роли вариабильности бактериальной орофарингеальной контаминации в зависимости от особенностей течения заболевания, по-прежнему мало. В связи с этим идентификация бактериального состава сообщества микроорганизмов дыхательных путей у больных ХОБЛ в зависимости от степени тяжести и фенотипа заболевания остается важной темой дальнейших научных исследований, новым путем к персонализированной медицине.
Цель исследования: установить характер вариабильности орофарингиальной микробиоты у пациентов с различными клинико-функциональными особенностями течения ХОБЛ.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В исследование были включены 98 пациентов с ХОБЛ. Средний возраст составил 57 (50–63) лет. Все участники исследования имели подтвержденный согласно критериям GOLD диагноз ХОБЛ [1] и стаж курения более 10 лет. На протяжении 4-х нед, предшествовавших включению в исследование, у них не были зарегистрированы обострения ХОБЛ.
Исследование включало два визита пациентов. Во время первого визита всем больным проводилось объективное клиническое обследование со сбором анамнеза. Толерантность к физической нагрузке определялась при проведении 6-минутного шагового теста. Степень одышки оценивалась по шкале mMRS. Всем пациентам проводилось исследование функции внешнего дыхания с бронхолитической пробой (ФВД); общая бодиплетизмография, исследование диффузионной способности легких (DL CO). Исследование проводили на оборудовании MasterScreen Body (Erich Jaeger, Германия). Полученные данные сопоставляли с должными величинами, рассчитанными по формулам, рекомендованным Европейским респираторным и Американским торакальным обществами [13]. У всех больных во время первого визита взяты орофарингеальные мазки.
Во время второго визита всем больным проводилось объективное клиническое обследование с оценкой частоты обострений в течение последних 12 мес. Определялась толерантность к физической нагрузке, оценивалась степень одышки по шкале mMRS, проводилось исследование ФВД с бронхолитической пробой, выполнялась оценка динамики течения ХОБЛ за 12 мес наблюдения, учитывающая степень одышки, толерантность к физической нагрузке, постбронходилатационное значение ОФВ1 и количество обострений (GOLD, 2014). Динамика заболевания считалась отрицательной, если при повторном обследовании пациент был отнесен к страте ХОБЛ (А-В или С-D) с более тяжелым течением.
Пациенты стратифицированы по степени тяжести заболевания и фенотипам следующим образом:
- 1-й тип стратификации: на основании классификации ХОБЛ по степени тяжести 98 пациентов основной группы разделены на две страты (ОФВ1 ≥50% от должного) и (ОФВ1 <50% от должного). 67 пациентов с ХОБЛ вошли в страту с ОФВ1 ≥50% и 31 пациент – в страту с ОФВ1 <50%.
- 2-й тип стратификации: на основан...
