Эпидемиология и Инфекционные болезни. Актуальные вопросы №2 / 2017
Микробиота ротоглотки при респираторных инфекционных воспалительных заболеваниях
ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И.Мечникова», Москва, Россия
Цель исследования. Изучение видового и родового состава и антибиотикочувствительности микробиоты ротоглотки при респираторных инфекционно-воспалительных заболеваниях.
Материалы и методы. Обследовано 189 пациентов с хроническим ринитом/ринофарингитом, аллергическим ринитом, острым назофарингитом и др. Мазки собирали с задней стенки глотки и миндалин, изоляты идентифицировали классическими физиолого-биохимическими методами. Чувствительность к антибиотикам оценивали диско-диффузионным методом.
Результаты. Получено 495 изолятов микроорганизмов, идентифицировано 25 родов и 28 видов. Преобладали Staphylococcus aureus (57,7%), Enterococcus spp. ( 49,2 %), Streptococcus agalactiae (32,8 %), Neisseria spp. (14,3%), Streptococcus pyogenes (13,8%). Аминогликозиды, макролиды и линкозамиды проявляли невысокую эффективность in vitro по сравнению с препаратами других групп в отношении всех перечисленных видов бактерий.
Заключение. Сравнение чувствительности штаммов S. aureus к антибиотикам, выявленной в 1998, 2005 и 2016 гг., показало снижение чувствительности к гентамицину за 20 лет с 85,1 до 39,6%, в то время как доксициклин, азитромицин, линкомицин и хлорамфеникол проявляли наименьшую эффективность in vitro в 2005 г., а к настоящему времени этот показатель значительно увеличился.
Лабораторная диагностика рецидивирующих респираторных инфекционно-воспалительных заболеваний (РИВЗ), наряду с традиционными инструментальными методами обследования и общим анализом крови, включает специфические анализы на выявление возбудителя – серологические и микробиологические тесты. Исследование микробиоты чаще всего сводится к бактериологическим посевам отделяемого из носа, бронхов и ротоглотки. Посев из ротоглотки является достаточно показательным тестом, поскольку микробиота данного локуса во многом определяется затёком отделяемого из носовой полости и попаданием секрета из нижних дыхательных путей при кашле. Состав эу- и прокариотных микроорганизмов ротоглотки, встречающихся при разных нозологических формах РИВЗ изучали разные исследователи [1–9]. Установлено, что он варьирует в зависимости от географического расположения страны и методов исследования, но, как правило, сводится к нескольким типам (Phyla) бактерий: Firmicutes, Fusobacteria, Bacteroidetes, Proteobacteria и Actinobacteria. Внедрение молекулярных методов значительно расширило спектр микроорганизмов, обнаруживаемых в ротоглотке, однако превалирующие виды остаются примерно теми же – это золотистый стафилококк и некоторые виды стрептококков. Но помимо видового/родового состава микроорганизмов и их количественной характеристики для назначения адекватной антибиотикотерапии клиницисту важно знать спектр антибиотикочувствительности выделенных от пациента условно-патогенных микроорганизмов, в чем молекулярные методы рутинного характер помочь не могут. На основании получаемых в микробиологической лаборатории данных необходимо периодически проводить мониторирование как видового состава, так и чувствительности/резистентности микроорганизмов к набору антибиотиков, так как это дает возможность назначения адекватной антибактериальной терапии в короткие сроки без предварительного бактериологического исследования. В связи с вышеизложенным целью настоящего исследования явилось изучение видового состава и антибиотикочувствительности микробиоты ротоглотки при РИВЗ.
Материалы и методы
В исследование были включены 189 человек в возрасте от 1 года до 46 лет, прошедших обследование в консультативно-поликлиническом отделении при ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И.Мечникова» за период с 2013 по 2016 г. Критерием включения явилось наличие РИВЗ Диагнозы выставлялись клиницистами в соответствии с МКБ-10.
Мазки производили стерильными ватными тампонами с задней стенки глотки и поверхности миндалин. Тампоны помещали в транспортную среду и доставляли в лабораторию, где проводили посевы на чашки с селективными средами: Эндо, Сабуро, желточно-солевым агаром, кровяным агаром и шоколодным агаром. Чашки инкубировали в термостате в течение 1–2 суток в зависимости от среды, после чего появившиеся колонии подсчитывали и проводили идентификацию аэробных и факультативно-анаэробных микроорганизмов с помощью стандартных физиолого-биохимических тестов (ассимилляция углеводов и других субстратов, наличие ферментативной активности уреазы, каталазы, оксидазы и др., окрашивание по Граму и микроскопирование) [10–13].
Чувствительность возбудителей к антибиотикам определяли дискодиффузионным способом по усовершенствованному методу Керби–Бауэра с помощью стандартных дисков с антибиотиками [14]. Статистическую обработку данных проводили с использованием программы Microsoft Excel.
Результаты и обсуждение
Спектр рецидивирующих РИВЗ в группе обследованных представлен на рис. 1. (см. на вклейке). Видно, что лидирующие позиции занимали хронический ринит/хронический ринофарингит, аллергический ринит и острый назофарингит; гораздо реже встречались болезнь аденоидов/миндалин, бронхиальная астма, хроническая обструктивная болезнь легких и ангина/острый тонзиллит.
В результате обследования 189 пациентов получено 495 изолятов, которые классическими методами удалось идентифицировать до уровня рода (25 родов) или вида (28 видов). Результаты идентификации выделенных штаммов микроорганизмов представлены в табл. 1. Наиболее часто встречались (в порядке убывания): Staphylococcus aureus (S. aureus), Enterococcus spp., Streptococcus agalactiae (Str. agalactiae), Neisseria spp. и Streptococcus pyogenes (Str. pyogenes). Прочие роды встречались не чаще, чем в 10% случаев. Данные, полученные другими исследователями при изучении традиционными методами мик...