Противовирусная активность фавипиравира в отношении новых вариантов SARS-CoV-2 дельта и омикрон

Цель исследования. Изучение противовирусной активности фавипиравира в отношении различных вариантов SARS-CoV-2.
Материалы и методы. Была изучена in vitro противовирусная активность препарата против 3 вариантов коронавируса SARS-CoV-2: штаммов В.1.1, дельта и омикрон, в клетках Vero. Результаты оценивали по уменьшению урожая вирусной РНК в зараженных клетках методом ПЦР с обратной транскрипцией с детекцией в режиме реального времени.
Результаты. Фавипиравир эффективно ингибировал репродукцию SARS-CoV-2, при этом ингибирующая концентрация ЕС50 существенно не различалась между вариантами вируса, находясь в интервале 200–300 мкM для всех штаммов.
Заключение. Эволюционные изменения вируса SARS-CoV-2 не оказали значимого влияния на активность препарата in vitro, которая сохраняется в отношении новых вариантов SARS-CoV-2

В декабре 2019 г. в Ухане (КНР) возникла эпидемическая вспышка острого респираторного заболевания COVID- 19, ассоциированного с вирусом SARS-CoV-2. Инфекция стремительно распространилась по всей территории Китая. 31 декабря 2019 г. ВОЗ признала вспышку инфекции, а 30 января 2020 г. объявила чрезвычайную ситуацию на международном уровне и глобальную пандемию – 11 марта 2020 г. Случаи коронавирусной инфекции были зарегистрированы в большинстве стран мира [1].

С начала пандемии эпидемическая ситуация по COVID- 19 динамично изменяется. В 2021 г. широкое распространение получил сначала вариант коронавируса дельта, характеризующийся более высокой смертностью, а затем южноафриканский вариант – омикрон, отличающийся значительной скоростью распространения в человеческой популяции за счет высокого коэффициента передачи [1].

Фавипиравир (Ф) является ингибитором РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp) – ключевого белка, участвующего в репликации генома вируса SARS-CoV-2. Попадая в клетку, он метаболизируется до активного метаболита трифосфата Ф, который, связываясь с RdRp, эффективно подавляет размножение вируса двумя возможными путями: остановкой синтеза РНК после присоединения двух остатков фавипиравира в растущую цепь [2, 3], либо встраиванием в РНК вируса и индукцией летального мутагенеза [4–6]. Ф активен в отношении различных классов вирусов с РНК-геномами, в том числе из семейства Coronaviridae [7–11]. При этом основным механизмом действия в отношении SARS-CoV-2 является индукция летального мутагенеза вследствие аккумуляции ошибок в геноме вируса [11]. Ранее была продемонстрирована активность препарата в отношении SARS-CoV-2 в исследованиях in vitro [12–14] и in vivo [12, 15], а также в ряде клинических исследований [16–21], что позволило внести препараты на основе Ф в клинические рекомендации по лечению новой коронавирусной инфекции [22]. Однако большинство исследований было проведено на ранних вариантах SARS-CoV-2. В ряде более поздних клинических исследований Ф не показал статистически значимого различия по сравнению с плацебо [23–26], это дало основания предположить, что, хотя изменения в гене RdRp вследствие эволюции вируса незначительны, Ф мог утратить свою эффективность в отношении новых вариантов SARS-CoV-2 дельта и, возможно, омикрон. Таким образом, возникла необходимость оценки эффективности ингибирования Ф новых вариантов SARS-CoV-2 для понимания возможности его дальнейшего использования в лечении новой коронавирусной инфекции. Поэтому настоящее исследование было посвящено изучению фармакологической активности Ф in vitro в отношении вариантов SARS-CoV-2 дельта и омикрон в сравнении с более ранним прототипным «европейским» штаммом клада В.1.1.

Материалы и методы

Линия клеток почки зеленой мартышки Vero получена из Biologicals (ВОЗ, Швейцария). Клетки вели на среде Игла, мо...

Крышень К.Л., Волок В.П., Шустова Е.Ю., Шипунов Г.А., Зинченко А.В., Самсонов М.Ю., Филон О.В., Шипаева Е.В.