Эпидемиология и Инфекционные болезни. Актуальные вопросы №3 / 2023
Связанность эпидемий ВИЧ-инфекции в Республике Армения и Российской Федерации
1) Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия;
2) ЗАО «Национальный центр инфекционных болезней», Министерство здравоохранения Республики Армения, Ереван, Республика Армения
Цель исследования. Генетическая характеристика вариантов ВИЧ, циркулирующих среди граждан Армении, и оценка степени связанности эпидемий ВИЧ-инфекции между Арменией и Российской Федерацией.
Материалы и методы. Исследованы 1009 нуклеотидных последовательностей ВИЧ региона pol и сопутствующая деперсонифицированная информация о пациентах, полученные в рамках распоряжений Правительства РФ, выполненных в 2016–2021 гг. Для оценки связанности эпидемии ВИЧ-инфекции анализировали также последовательности из базы данных Лос-Аламос и коллекции Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора. К полученному пулу последовательностей были применены инструмент BLAST, филогенетический и кластерный анализ.
Результаты. Среди проанализированных последовательностей ВИЧ граждан Армении 87,2% принадлежали к субсубтипу А6, 5,6% – к субтипу В, 2,7% – CRF63_02А6 и 1,9% – CRF02_AG. Другие генетические варианты встречались реже (1%). Наибольшее количество генетически родственных последовательностей ВИЧ имели российское происхождение (44,52%), затем следовали Республика Беларусь (10,59%) и США (8,04%). С помощью кластерного анализа было обнаружено, что достоверно чаще смешанные AM-RU кластеры состояли из мужчин, пациентов с гомосексуальным путем передачи, проживающих в пригороде Еревана, инфицирование которых предположительно произошло в России.
Заключение. Биоинформатический анализ нуклеотидных последовательностей ВИЧ, полученных от граждан Республики Армения, в сочетании с генетическими вариантами ВИЧ, доступными на сегодняшний день, показал высокую генетическую близость последовательностей ВИЧ Армении и Российской Федерации.
Первый случай заражения ВИЧ в СССР был обнаружен в 1985 г. у гражданина Африки [1]. До середины 90-х гг. XX в. в СССР, а затем в Российской Федерации регистрировали небольшое число случаев инфицирования, к 1995 г. лиц, живущих с ВИЧ (ЛЖВ), в стране насчитывалось менее 1000 чел. Однако начиная с 1996 г., вследствие попадания вируса в уязвимую группу лиц, употребляющих инъекционные наркотики, скорость его распространения значительно увеличилась. До 2016 г. ежегодно более 50% новых случаев инфекции были вызваны парентеральным путем передачи. Быстрое развитие эпидемии ВИЧ-инфекции в России стало одной из причин высокой пораженности населения в настоящее время. Согласно опубликованным данным [2], к 2021 г. число ЛЖВ в стране достигло 1 137 596 чел., что составляет 0,8% общей численности населения страны и 1,5% населения в возрасте от 15 до 49 лет.
Развитие эпидемии ВИЧ-инфекции в Республике Армения (РА) происходило несколько иначе. С конца 1990-х гг. эпидемия начала распространяться в основном в группе потребляющих инъекционные наркотики. С 2004 г. в РА благодаря осуществлению национальной программы по профилактике ВИЧ/СПИДа возрос доступ к тестированию, был внедрен систематический эпидемиологический надзор за ВИЧ, дан старт профилактическим программам. В следующее десятилетие развитие эпидемии под влиянием внутренних и внешних факторов изменилось, и сейчас она характеризуется тем, что основным путем передачи являлся гетеросексуальный (в 2009–2018 гг. – 76,5%). В этот период 56% зараженных ВИЧ были инфицированы за рубежом, среди зарегистрированных случаев значительное влияние имел фактор миграции (66%) [3]. В последнее время, кроме этих особенностей, наблюдается также распространение ВИЧ-инфекции среди мужчин, практикующих секс с мужчинами, составив 11% всех случаев годовой регистрации. С 1988 г. по 31 декабря 2022 г. в стране было зарегистрировано 5114 случаев заражения среди граждан РА. Основными путями передачи ВИЧ-инфекции являются гетеросексуальные контакты (75,0%), потребление инъекционных наркотиков (15,9%) и гомосексуальный путь передачи (6,4%) (https://ncid.am/statistics/).
Российская Федерация и РА связаны между собой чрезвычайно сильно. По данным Федеральной миграционной службы России, в РФ ежегодно регистрируются до 500 000 граждан Армении, являющихся трудовыми мигрантами. Согласно проведенным опросам, одновременно в РА находятся примерно 80 000–100 000 возвращающихся трудовых мигрантов [4]. Почти все они мужчины. В 2017 г. из 358 новых случаев ВИЧ-инфекции, выявленных в РА, 56% приходилось на долю вернувшихся трудовых мигрантов, 9% – на долю их партнеров. В исследовании, проведенном в 2016 г. с использованием методов многоэтапной кластерной выборки в 6 регионах Армении, было установлено, что распространенность ВИЧ среди возвращающихся сельских трудовых мигрантов составила 0,6% в возрастной группе 18–49 лет [5].
Хроническое течение болезни, неспецифические клинические признаки, поздняя диагностика осложняют определение региона инфицирования. В то же время в решении этой задачи могут быть с успехом применены молекулярные и биоинформатические методы [6, 7]. В случае секвенирования достаточного количества ВИЧ-инфицированных лиц на изучаемых территориях можно не только определить географическое направление распространения вируса, но и оценить степень связанности эпидемий [8].
До настоящего времени секвенирование ВИЧ граждан РА осуществлялось в крайне ограниченном количестве, что делало невозможным проведение анализа связанности эпидемий с помощью биоинформатических методов. В связи с этим целью нашей работы были анализ генетического разнообразия вариантов ВИЧ, циркулирующих на территории РА; поиск стран, в которых проживают ВИЧ-инфицированные, эпидемиологически связанные с армянскими гражданами, и оценка степени связанности эпидемий ВИЧ-инфекции между РА и Российской Федерацией.
Материалы и методы
В работе были использованы нуклеотидные последовательности региона pol, кодирующие гены протеазы...
