Влияние пандемии COVID-19 на структуру микробиоценоза кишечника

Цель исследования. Сравнение эпидемиологических закономерностей распространения нарушений микробиоценоза кишечника среди населения Российской Федерации до и во время пандемии новой коронавирусной инфекции SARS-CoV-2.
Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ результатов обследований на выявление нарушений микробиоценоза кишечника среди 72 798 пациентов в возрасте от 1 до 60 лет в периоды 01.2018–03.2020 и 04.2020–12.2022. Посев клинического материала на питательные среды и учет результатов проводили традиционными микробиологическими методами. Статистический анализ данных проводили с использованием стандартных методов описательной статистики с помощью программы Microsoft Office Excel 2010. Средние значения оценивали с учетом 95% доверительного интервала (95% ДИ) по методу Клоппера–Пирсона.
Результаты. В возрастной группе от 1 года до 60 лет выявлен рост нарушений микробиоценоза кишечника во время пандемии COVID-19 по сравнению с годами до пандемии. В 2018 – начале 2020 г. показатель не превышал 2,4 ± 0,02%, с 04.2020 он вырос до 77,9 ± 0,08%. Пандемия существенно изменила микробиоценоз кишечника в сторону преобладания условно-патогенной (Klebsiella spp., Enterobacter spp., Proteus spp.) и патогенной (Salmonella spp., Shigella spp.) флоры.
Заключение. Показатели микробиоценоза кишечника у пациентов в возрасте от 1 года до 60 лет до пандемии новой коронавирусной инфекции COVID-19 и во время пандемии значительно отличаются: происходит сдвиг в сторону увеличения дисбиоза, вызванного ростом условно-патогенной и патогенной флоры на фоне снижения облигатных симбионтов бифидобактерий, лактобактерий, энтерококков и типичной E. coli. Выявлено деструктивное влияние различных геновариантов вируса SARS-CoV-2 на кишечный микробиоценоз, выражающееся в повреждении филометаболического ядра, что может быть связано как с обширным применением антибиотиков, так и с повреждающим воздействием вируса на кишечник.

COVID-19 представляет собой высококонтагиозную патогенную вирусную инфекцию, вызванную штаммом SARS-CoV-2, быстро распространившуюся по всему миру. В первую очередь новая коронавирусная инфекция поражает дыхательную систему, но появляется все больше данных о вовлечении в патогенез инфекции желудочно-кишечного тракта [1]. Помимо наиболее распространенных симптомов COVID-19 – лихорадки, кашля и миалгии, наблюдались также боль в горле, головная боль, озноб, тошнота, рвота и диарея. Желудочно-кишечные симптомы, которые сохранялись в течение длительного времени, включали тошноту, боль в животе, потерю аппетита, изжогу и запор [2–4]. Кишечные расстройства, наблюдаемые при тяжелом течении инфекции SARS-CoV-2, связаны как с повреждающим действием энтероцитов путем связывания с ангиотензинпревращающим рецептором 2 (ACE2) [5], так и с нарушением микробиоценоза кишечника. Существуют данные, что состав кишечной микрофлоры значительно изменяется у пациентов с COVID-19, снижается колонизационная резистентность и нарушается баланс в структуре филометаболического ядра [6, 7].

Микробиоценоз кишечника имеет важное общебиологическое значение для организма человека на протяжении всей его жизни [8]. Облигатная микро­флора кишечника участвует в регулировке физиологических, биохимических и иммунологических процессов в организме, в том числе в защите от патогенов, и поддерживает метаболизм питательных веществ [8, 9]. Фактически желудочно-кишечный тракт считается крупнейшим иммунным органом в организме, который может регулировать иммунитет хозяина, защищать от патогенов и поддерживать метаболизм питательных веществ [9]. Кишечный микробиоценоз играет большую роль в поддержании здоровья человека, в том числе в обеспечении защиты от кишечных бактериальных патогенов, но ряд факторов, таких как инфекции или необоснованное применение антибиотиков, могут нарушить этот баланс [10]. Сохраняется актуальность использования антибиотиков в период пандемии COVID-19.

Цель исследования – анализ влияния пандемии новой коронавирусной инфекции, вызванной вирусом SARS-CoV-2, на структуру микробиоценоза кишечника по сравнению с показателями микробиоценоза до пандемии.

Материалы и методы

Методом случайной выборки был проведен ретроспективный анализ результатов исследования микробиоценоза кишечника среди населения Российской Федерации до и во время пандемии COVID-19. Число пациентов в возрасте от 1 до 60 лет, обследованных в период с января 2018 г. по декабрь 2022 г. составило 72 798.

Исследовали пробы фекалий по мере их поступления в лаборатории лечебных учреждений. Для приготовления суспензии 0,5 г клинического материала, поступавшего в специальных контейнерах, эмульгировали в солевом буфере с редуцирующими компонентами. Затем готовили ряд последовательных десятикратных разведений материала на том же буфере и засевали на чашки Петри с питательными средами. Посев клинического материала на питательные среды и учет результатов проводили согласно ОСТ 91500.11.0004-2003 «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника» на следующие питательные среды: агар Эндо и Плоскирева для изоляции бактерий семейства Enterobacterales, желточно-солевой агар – для бактерий семейства Staphylococcaceae, энтерококковый агар – для культур рода Enterococcus spp., среда МРС с сорбиновой кислотой – для лактобактерий, Бифидум-среда – для бифидобактерий, среда Шедлера – для выделения основной группы анаэробных...

Битюмина Л.А., Куликова Н.Г., Плоскирева А.А., Горелов А.В.