Медицинский Вестник №29 (606) / 2012
Генетика предрасположенностей: разбитые мечты и утраченные грезы
Такое романтическое название дал своему докладу доцент кафедры физики, математики и информатики Санкт-Петербургского государственного медицинского университета им. акад. И.П. Павлова кандидат биологических наук Никита ХРОМОВ-БОРИСОВ, областью научных интересов которого являются биомедицинская статистика и генетика. Выступление прозвучало в ходе научно-практической конференции «Иммунофизиология. Аутоиммунитет в норме и патологии и вопросы предиктивно-превентивной медицины», состоявшейся в иннограде Сколково.
Большие надежды
Как отметил выступающий, основной вклад в структуру заболеваемости и смертности населения вносят болезни, которые принято называть мультифакторными, т.е., говоря по-русски, многопричинными. Но какие могут быть причины у болезней? Не только генетические, но и обусловленные средой обитания человека — экологией, его привычками, образом жизни, качеством и стилем питания.
— После секвенирования генома человека забрезжила надежда, что теперь-то мы сможем познать генетические причины таких заболеваний и научимся их предсказывать с высокой точностью и надежностью. Казалось, что для этого достаточно будет максимально полно изучить генетический полиморфизм популяций человека и найти те генетические варианты (аллели, генотипы или гаплотипы), которые обуславливают предрасположенность к болезням.
В 90-е годы прошлого века эти надежды окрепли благодаря открытию целого ряда генов, связанных с такими опасными и распространенными заболеваниями, как рак молочной железы, ВИЧ-инфекция, тромбоз вен. Впоследствии этот список стал стремительно расти за счет внедрения технологии широкогеномного генотипирования (GWAS). Но уже через 10 лет стало ясно, что надежды не оправдываются: результаты GWAS устойчиво демонстрируют крайне плохую воспроизводимость, то есть в различных исследованиях находят непересекающиеся группы связанных с болезнью «снипов» (SNP). Или же ассоциированные SNP находят совсем не в тех генах или участках хромосом, в которых их рассчитывали найти, — представил проблему Никита Хромов-Борисов.
Напомним, что «снипами» называют однонуклеотидный полиморфизм (Single nucleotide polymorphism, SNP) — это отличия последовательности ДНК размером в один нуклеотид в геноме.
Эволюционные аспекты
Докладчик привел высказывание Феодосия Добржанского, советского генетика, уехавшего в 30-е годы в США, кстати, являющегося правнуком родной сестры Ф.М. Достоевского: «Ничто в биологии не имеет смысла, кроме как в свете эволюции». В этом контексте, по мнению Никиты Хромова-Борисова, один из первейших вопросов, на который должна дать ответ «генетика предрасположенностей», может звучать так: является ли генетический полиморфизм, выявляемый современной геномикой, результатом нейтральной эволюции или же он являетс...
