Медицинский Вестник №34 (647) / 2013
Наши «пассажиры»
Применение новейших методов исследования позволило поставить изучение микробиоты кишечника в один ряд с самыми популярными направлениями биологии и медицины, а микрофлору организма считать отдельным «органом» человека. Масштабные работы в этой области ведутся в НИИ физико-химической медицины ФМБА России.
Применение новейших методов исследования позволило поставить изучение микробиоты кишечника в один ряд с самыми популярными направлениями биологии и медицины, а микрофлору организма считать отдельным «органом» человека. Масштабные работы в этой области ведутся в НИИ физико-химической медицины ФМБА России.
Невидимок выводят на свет
В биологии сейчас востребованы самые разные специалисты — физики, математики, биологи, врачи, программисты, поскольку появились приборы, позволяющие считывать геномную информацию, транскриптом, осуществлять протеомный анализ. Значит, нужны люди, которые умеют эти данные обсчитывать и анализировать, поэтому изучением микробиоты в институте заняты сотрудники лаборатории биоинформатики отдела молекулярной биологии и генетики, которым руководит заместитель директора НИИ по научной работе член-корреспондент РАМН Вадим Говорун.
Младший научный сотрудник лаборатории биоинформатики Александр Тяхт представляет концепцию проекта:
— По оценкам, около 2/3 бактериальных видов, обитающих в кишечнике, не поддаются культивации, т.е. не удается подобрать среду и условия для их размножения. Результаты обычного анализа кала укладываются в 10—20 показателей, однако с помощью методов высокопроизводительного секвенирования обнаружилось огромное разнообразие видов бактерий в кишечнике человека как главном резервуаре бактерий, а также в других органах — от нескольких сотен до тысячи видов. И эта оценка сильно отличается от того числа, которое можно традиционно выявить. Затем ученые обратились к функции микробиоты, и оказалось, что бактерии, которые живут внутри человеческого организма, не просто «пассажиры», а играют активную роль, и их можно рассматривать, как последний открытый учеными орган человека, поскольку количество клеток в нем на один-два порядка больше, чем клеток в организме человека.
И чем они там все заняты?
Благодаря секвенированию было каталогизировано порядка трех миллионов различных генов бактерий, имеющих разные функции. Для сравнения: в геноме человека около 20 тысяч генов. Таким образом, можно говорить о чрезмерном генетическом богатстве микробиоты.
— Ученые провели ряд экспериментов с использованием стерильных животных (мышей), которым подсаживали те или иные микробы. Показано, что без микробиоты организму мыши очень плохо живется: он ненормально развивается, присутствуют проблемы с иммунитетом. Микробиота п...
