Вирусурия как составляющая микробиоты мочи и ее значение для оценки состояния здоровья мочевого тракта: описательное клиническое исследование

Цель: определить встречаемость условно-патогенной бактериальной флоры и вирусных патогенов в моче здоровых людей с установлением взаимосвязи между ними. Материалы и методы. Обследованы 40 здоровых сексуально активных женщин (n=19) и мужчин (n=21) в возрасте от 20 до 25 лет (средний возраст – 22,4±1,2 года). В обеих группах на исследование забирали среднюю порцию утренней мочи после соответствующей гигиенической процедуры при самостоятельном мочеиспускании обследуемых в стерильный пластиковый контейнер. Помимо питательных сред, регламентированных в Клинических рекомендациях, использовали дополнительные хромогенные среды HiMedia для культивирования факультативно-анаэробных и неклостридиальных анаэробных бактерий. Определение вирусов осуществляли методом ПЦР с детекцией в режиме реального времени. Выделение ДНК производили сорбционным методом с использованием набора АмплиПрайм ДНК-сорб-В («НекстБио») из образцов мочи с предварительным концентрированием. Результаты. Во всех 40 случаях в моче обнаружена нормативная лейкоцитурия. По результатам бактериологического исследования мочи у здоровых мужчин и женщин во всех случаях обнаруживали аэробно-анаэробные ассоциации. В кластере аэробных таксонов микробиоты доминировали коагулазоотрицательные стафилококки (CNS) и Corynebacterium spp. (75 и 55% соответственно). Спектр CNS был представлен пятью видами: S. epidermidis (30%), S. haemolyticus (27,5%) и S. warneri (25%), S. saprophyticus и S. lentus (по 15%). Enterococcus spp. регистрировали в моче в 32,5% случаев. Представители семейства Enterobacteriaceae были представлены четырьмя таксонами: E. coli (10%), Klebsiella spp., Proteus spp. (по 5%), Enterobacter spp., Citrobacter spp. (по 2,5%). В кластере анаэробных бактерий в моче преобладали Eubacterium spp. (60%), практически у половины здоровых лиц регистрировали Lactobacillus spp. и Peptococcus spp. (по 42,5%). При анализе частот обнаружения различных таксонов микробиоты установлено, что у женщин достоверно чаще в моче регистрировали Corynebacterium spp., Eubacterium spp. и Lactobacillus spp., а также Enterococcus spp. и Peptococcus spp. У мужчин в моче достоверно чаще (p<0,05) определялись Peptostreptococcus spp., Veillonella spp. У здоровых людей в моче были обнаружены HHV6 (10%), HPV18 и парвовирусы B19 (по 2,5%). Изученные вирусы чаще регистрировались у мужчин, в частности HPV 18 и парвовирус В19 – только у мужчин, HHV6 – чаще у мужчин (7,5%), реже у женщин (2,5%). Значимые связи некоторых родов микроорганизмов с полом обследуемых выявлены для E. faecalis и Lactobacillus spp., которые чаще обнаруживали в моче здоровых женщин. Достоверно значимые взаимосвязи обнаружены для трех таксонов: при наличии в моче Bacteroides spp., Bifidobacterium spp., Prevotella spp. определялись вирусы HPV6, HPV18 и парвовирусы B19 (16,7%). Соответственно, в 83,3% случаев данные вирусы обнаруживали в отсутствие в моче вышеперечисленных таксонов микроорганизмов. Выводы. Микробиота мочи в норме у здоровых женщин и мужчин имеет различия: у мужчин в моче отсутствуют Lactobacillus spp. и Candida spp., у женщин – Streptococcus spp. В моче здоровых людей регистрируют HHV6, HPV18, парвовирусы B19, причем чаще у мужчин. Данные о виробиоте и микробиоте мочи у здоровых людей могут пролить свет на патогенез инфекции мочевых путей различной локализации и разработать направленные подходы к персонализированной терапии данной группы заболеваний.

Введение. Среди исследователей продолжает доминировать следующая точка: моча человека служит стерильной средой, и отрицательный результат культурального исследования мочи свидетельствует о «здоровье» мочевого тракта [1–3]. В то же время в последнее десятилетие формируется новая парадигма, согласно которой моча каждого человека имеет свой индивидуальный спектр микробиоты и виробиоты [4, 5]. Этому способствует ряд факторов, в частности применение расширенного спектра методик культурального исследования мочи, MALDI-TOF масс-спектрометрии, молекулярно-биологических и метагеномных подходов, таких как ПЦР с обратной транскриптазой или в режиме реального времени, 454 пиросеквенирования гена 16S-рРНК и др. [6, 7].

Исследования микробиома и микробиоты мочи показали, что в мочевом тракте присутствуют разнообразные бактериальные сообщества, в том числе Lactobacillus spp., Bifidobacterium spp., Actinomyces spp., Enterococcus spp., Streptococcus spp., Corynebacterium spp., E. coli, Staphylococcus spp., Aerococcus spp., Gardnerella spp., Ureaplasma spp., Actinobaculum spp. и др. [8, 9]. D. E. Nelson и et al. [10] в моче сексуально активных мужчин обнаружили различные таксоны микроорганизмов, в частности Sneathia spp., Gemella spp., Aerococcus spp., Anaerococcus spp., Prevotella spp. и Veillonella spp., которые имели корреляцию с микробным спектром при инфекциях, передающихся половым путем (ИППП). Вместе с тем данные литературы о вирусных уропатогенах разрозненны и не систематизированы. Время от времени появляются сообщения о наличии аденовирусов, герпесвирусов, ВК- и JC-полиомавирусов в моче лиц с ослабленным иммунитетом и после трансплантации костного мозга при развитии у них геморрагического цистита [11, 12]. В ряде работ обсуждается роль вирусов папилломы человека (HPV), аденовирусов, а также вирусов простого герпеса 1-го и 2-го типов (HSV 1, 2) в генезе рецидивирующей инфекции нижних мочевыводящих путей [13–15]. Для понимания роли вирусных и бактериальных патогенов при инфекционно-воспалительных поражениях органов мочевой системы необходимы знания о бактериальном и вирусном спектрах мочи здоровых людей.

Цель исследования: определить встречаемость представителей условно-патогенной бактериальной флоры и вирусных патогенов в моче здоровых людей с установлением взаимосвязи между ними.

Материалы и методы. Обследованы 40 здоровых сексуально активных женщин (n=19) и мужчин (n=21) в возрасте от 20 до 25 лет (средний возраст – 22,4±1,2 года). Критерии включения в исследование: возраст до 25 лет, отсутствие гинекологических заболеваний (в группе женщин), урологических заболеваний в обеих группах; формально нормативные показатели общего анализа крови и мочи, согласие на участие в исследовании. Наличие ИППП как в анамнезе, так и на момент исследования, отсутствие инфекционных, генетических, соматических заболеваний, различных факторов риска (радиоактивное облучение и т.д.), патологических изменений почек и мочевой системы, внутренних половых органов при УЗИ, прием различных препаратов (антибиотиков, кортикостероидов), а также противозачаточных (в группе женщин) за 2 мес. до забора мочи – все это было критериями невключения в исследование. Из исследования также исключали мужчин с ранее диагностированным крипторхизмом и орхитом.

На исследование забирали среднюю порцию утренней мочи после соответствующей гигиенической процедуры при самостоятельном мочеиспускании обследуемых в стерильный пластиковый контейнер («HiMedia»). Пробы мочи кодировали идентификационным номером и разделяли на 3 аликвоты: 1 – для проведения общего анализа мочи, 2 – для бактериологического исследования мочи, 3 – для проведения ПЦР. Бактериологическое исследовани...

Ю.Л. Набока, И.А. Гудима, С.В. Морданов, Д.В. Крахоткин, А.В. Ильяш, М.И. Коган, Д.В. Сизякин, Х.С. Ибишев