Генетические полиморфизмы генов HNF1B, CASC17, CASC8 И CCAT2, ассоциированных с риском развития рака простаты, у пациентов урологического профиля

Цель исследования. Провести сравнительный анализ комбинаций аллельных вариантов SNP rs4430796 (HNF1B), rs1859962 (CASC17), rs1447295 (CASC8) и rs6983267 (CCAT2) у пациентов урологического профиля.
Материалы и методы. Проведено генетическое исследование крови 236 пациентов российской популяции, среди которых 97 – с доброкачественной гиперплазией простаты (ДГП), 89 – с раком простаты (РП) и 50 – с мочекаменной болезнью (МКБ) – группа контроля. Выделение ДНК проводили из венозной крови, генотипирование – методом ПЦР с последующей рестрикционной деградацией. Частоты аллелей и генотипов сравнивали между группами с использованием χ²-критерия. Оценивали отношение шансов (OR) и 95% доверительные интервалы.
Результаты. Установлена ассоциация мутантных аллелей T (HNF1B) и C (CASC17) при РП и ДГП, отсутствующая в группе контроля. Генотип ТТ по rs4430796 (HNF1B) ассоциирован с повышенным риском опухоли простаты (OR=2,38; 95% CI: 1,26–4,47; p=0,004). Генотип СС по rs1859962 (CASC17) также ассоциирован с опухолью простаты (OR=3,80; 95% CI: 1,30–11,4; p=0,015). Комбинация ТТ (HNF1B) + СС (CASC17) отсутствовала у пациентов с МКБ, но часто встречалась у пациентов с РП и ДГП также рассматривается как возможный маркер опухолевого процесса. Площадь под кривой (AUC) составила 0,71, что соответствует умеренной диагностической ценности. Геномные комбинации GG TT (CASC8+CCAT2) и GG G/T различались между группами ДГП и РП. Выявлены уникальные комбинации по четырем SNP, характерные для пациентов с ДГП.
Заключение. Комбинированный анализ полиморфизмов rs4430796 и rs1859962 может служить основой для генетической стратификации риска РП в российской популяции. Выявленные геномные комбинации обладают потенциалом в качестве маркерных панелей для скрининга и дифференциации РП и ДГП, а также для развития персонализированных подходов в онкоурологии.

Введение. Рак простаты (РП) занимает лидирующие позиции в структуре онкозаболеваемости и смертности от злокачественных новообразований среди мужчин во всем мире [1, 2]. Значительные экономические затраты, связанные с лечением данной патологии, а также инвалидизация мужского населения указывают на необходимость разработки мероприятий, направленных на профилактику, раннее выявление, а также риска предрасположенности к РП [3]. В современных концепциях молекулярной стратификации риска РП большой интерес представляет генетический анализ.

Известно, что РП обладает высокой наследуемостью – до 60% риска обусловлено наследственными факторами [4]. Установлено более 100 однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), идентифицированных с помощью геномных ассоциативных исследований (GWAS), демонстрируют связь с предрасположенностью к РП [5, 6], а 7 SNP-маркеров (rs1048169, rs2961144, rs7000448, rs4430796, rs2066827, rs12500426 и rs114798100) демонстрируют повышенную частоту среди пациентов с РП, что подтверждает их потенциальную значимость как генетических маркеров предрасположенности к вышеуказанному заболеванию [7, 8].

Метаанализ, посвященный полиморфизму rs1859962 (17q24), показал, что аллель G достоверно ассоциирован с повышенным риском развития РП, особенно у европейской и азиатской популяций. Это подтверждает значение CASC17 как важного генетического локуса риска РП [9]. В метаанализе Zhao Y. с соавт. проанализированы данные из более чем 50 генетических исследований, посвященных связи SNP-маркеров в регионе 8q24 (таких как rs1447295, rs16901979, rs6983267) с риском развития РП. Подтверждено, что генетическая вариабельность в 8q24 — это не случайные полиморфизмы, а биологически значимые варианты, способствующие развитию РП через нарушение регуляции ключевых онкогенов, таких как MYC. Эти данные усиливают значение региона 8q24 как приоритетной мишени для генетического скрининга и стратификации риска [10]. Накопленный опыт указывает на важный вклад данных регионов генома в наследственную предрасположенность к РП [11]. Поэтому в настоящее время все более актуальными становятся интегративные мультиомные подходы, включая использование полигенных риск-оценок, многопротеиновых и транскриптомных панелей. На наш взгляд, в настоящее время ни один из существующих биомаркеров в отдельности не обеспечивает высокой точности диагностики или стратификации риска РП, необходимой для широкого внедрения персонализированных алгоритмов скрининга РП. Указанные ограничения обуславливают актуальность поиска новых маркеров. Несмотря на достижения генетических исследований, в российской клинической практике до сих пор не разработаны стандартизированные мультиплексные генетические панели для стратификации риска РП, что существенно ограничивает применение персонализированного подхода. В результате ранняя диагностика РП преимущественно основывается на традиционных методах диагностики, а генетические маркеры пока широко не используются.

Цель исследования. Провести сравнительный анализ комбинаций аллельных вариантов SNP rs4430796 (HNF1B), rs1859962 (CASC17), rs1447295 (CASC8) и rs6983267 (CCAT2) у пациентов урологического профиля.

Материалы и методы. Объектом исследования явились 236 рандомно отобранных пациентов, находившихся на лечении в клинике урологии Университетской клинической больницы № 1 им. С.Р. Миротворцева ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского» Минздрава России. Критерии включения: 1) пациенты русской национальности, не имеющие родства между собой, добровольно согласившиеся на проведение исследования; 2) пациенты с подтвержденным на основе клинических и лабораторно-инструментальных (в т.ч. морфологических) методов обследования диагнозом РП, без привязки к стадии заболевания, ДГП без привязки к стадии заболевания и МКБ. Исследование одобрено этическим комитетом ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В. И. Разумовского» Минздрава России. Все пациенты подписали информированное согласие на участие в исследовании.

Общая когорта пациентов подразделена на три группы: пациенты с РП, доказанным при морфологическом исследовании биоптатов этого органа (n=89; средний возраст – 72,3±6,4 года); пациенты с ДГП (n=97; средний возраст – 72,5±5,9 года). Группу контроля составили 50 пациентов с МКБ (средний возраст – 69,6±7,1 года).

Биологическим материалом для генетического исследования послужила венозная кровь пациентов – участников исследования. Выделение общей ДНК из образцов крови осуществляли колоночным методом с использованием коммерческого набора GeneJET Genomic DNA Purification Kit (#01108225, Thermo, Германия). Чистоту и концентрацию препаратов выделенной ДНК (OD260=1 соответствует 50 мкг/мл ДНК) оценивали методом УФ-спектрофотометрии с ...

Полуконова Н.В., Фомкин Р.Н., Пылаев Т.Е., Бучарская А.Б., Мезиров Г.Г., Воронина Е.С., Попков В.М., Фомкина О.А., Крупинов Г.Е.