Мониторинг сальмонелл пищевого происхождения, устойчивых к фторхинолонам и цефалоспоринам

Цель исследования. Оценка профиля устойчивости к противомикробным препаратам у изолятов Salmonella, выделенных из пищевых продуктов в Российской Федерации в 2018–2024 гг., с помощью фенотипического анализа и выявления генетических детерминант антибиотикорезистентности.
Материалы и методы. В 2018–2024 гг. проанализированы 3843 изолята нетифоидных Salmonella enterica subsp. enterica, полученных из пищевой продукции на территории России. Родовую идентификацию выполняли методом MALDI-TOF масс-спектрометрии. Серотипирование проводили реакцией агглютинации с использованием отечественных сальмонеллезных сывороток (ПЕТСАЛ, Россия) по схеме Кауффмана–Уайта. Фенотипическую чувствительность определяли методом серийных разведений в бульоне (МПК) на анализаторе Vitek 2 Compact. У мультирезистентных (MDR) изолятов гены антибиотикоустойчивости определяли с помощью полногеномного секвенирования (WGS).
Результаты. Наиболее часто Salmonella выделяли из птицепродукции (55,8%), кулинарной продукции (27,5%) и мясной продукции (14,2%); менее 1% изолятов получено из кондитерских, рыбных и молочных изделий. Зарегистрирована фенотипическая устойчивость к цефалоспоринам (18,1%), фторхинолонам (60,1%), аминогликозидам (18,1%), тетрациклинам (36,7%), хлорамфениколу (27,0%), триметоприму (66,1%), нитрофурантоину (59,1%), триметоприм-сульфаметоксазолу (21,9%) и карбапенемам (0,1%). Методом WGS изучено 31,2% выборки. Среди сиквенс-типов преобладали ST32 (S. Infantis), ST11 (S. Enteritidis), ST198 (S. Kentucky) и ST34 (S. Typhimurium). В геномах выявлены детерминанты резистентности к аминогликозидам (93,0 %), β-лактамам (46,4%), хинолонам (31,0%), тетрациклинам (97,4%), сульфаниламидам (89,6%), триметоприму (59,8%), фениколам (41,1%), макролидам (57,9%), а также (реже 1%) к линкозамидам, колистину и рифампицину.
Заключение. Птицепродукция является основным резервуаром сальмонелл, циркулирующие изоляты демонстрируют высокий уровень устойчивости к клинически значимым антибиотикам, прежде всего к фторхинолонам и триметоприму. Доминирование эпидемиологически значимых клонов (ST32, ST11, ST198, ST34) подчеркивает необходимость усиления контроля на всех этапах пищевой цепи и продолжения молекулярно-генетического мониторинга для отслеживания распространения резистентных клонов.

Инфекции, обусловленные бактериями рода Salmonella, на протяжении десятилетий остаются одной из ведущих причин возникновения пищевых вспышек и спорадической кишечной заболеваемости, формируя значимую долю санитарно-эпидемиологического бремени в Российской Федерации (РФ). По данным официальных докладов Роспотребнадзора, сальмонеллезы стабильно входят в число приоритетных для государственного надзора нозологий, а их профилактика напрямую связана с качеством лабораторного контроля пищевой продукции и совершенствованием методических подходов к выявлению возбудителя на всех этапах пищевой цепочки¹.

В последние годы среди российской популяции пищевых изолятов доминируют и сохраняют эпидемио­логическую значимость серовары и клоны Salmonella Enterica, известные высокой адаптивностью и резистентностью, например, S. Infantis (ST32), S. Enteritidis (ST11), S. Typhimurium (ST34) и S. Kentucky (ST198) [1]. Для S. Infantis, выделенных из мяса птицы и продуктов его переработки в России в 2018–2020 гг., показано формирование мультирезистентных линий с носительством pESI-подобных мегаплазмид, сочетающих гены устойчивости и вирулентности [2].

Российские исследования последних 5 лет демонстрируют значимую долю мультирезистентных изолятов сальмонелл к критически важным для клинической практики классам антибиотиков, таким как фторхинолоны, тетрациклины, цефалоспорины III поколения, ко-тримоксазол [3, 4].

Интеграция полногеномного секвенирования (WGS) в рутинный контроль, от лабораторий на предприятиях до референс-центров, обеспечивает воспроизводимое типирование и идентификацию детерминант резистентности к противомикробным препаратам. В российской практике такая интеграция уже доказала свою применимость и ценность, в т. ч. для S. Infantis и S. Kentucky, где геномные данные помогли охарактеризовать линии распространения и пути передачи по пищевой цепочке [5].

С практических позиций ключевым остается сопряжение лабораторной диагностики с системной профилактикой в пищевой отрасли, куда входят контроль качества сырья, управление критическими точками на предприятиях, стандартизация отбора и транспортировки проб, а также оперативное информационное взаимодействие между производственными лабораториями, территориальными подразделениями Рос­потреб­­надзора и референс-центрами.

Цель исследования － оценка профиля устойчивости к противомикробным препаратам у изолятов Salmonella, выделенных из пищевых продуктов в РФ в 2018–2024 гг., с помощью фенотипического анализа и выявления генетических детерминант антибиотикорезистентности.

Материалы и методы

Материалом для исследования служили культуры нетифоидных Salmonella Еnterica (n = 3843), изолированные на территории РФ в 2018–2024 гг. Выделение и первичную идентификацию бактериальных изолятов проводили в Федеральном центре гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора.

Все исследованные изоляты микроорганизмов были идентифицированы до рода методом матрично-активированной лазерной ионизации – времяпролетной масс-спектрометрии (MALDI-TOF MS) с применением системы Microflex LT и программного обеспечения MALDI Biotyper Compass v.4.1.80 (Bruker Daltonics, Германия). В качестве критерия надежной видовой идентификации на MALDI-TOF масс-спектрометрии использовали рекомендуемые значения Score ≥ 2,0. Серотипирование сальмонелл проводили при помощи реакции агглютинации с сальмонеллезными сыворотками (ПЕТСАЛ, Россия) согласно схеме Кауффмана–Уайта. Хранение изолятов бактерий осуществляли при температуре -70 °С в бульоне Мюллера–Хинтона с добавлением 10% глицерина [6].

Профили чувствительности к ...

Битюмина Л.А., Ярославцева М.А., Парамонова С.Н., Королева И.Б., Куликова Н.Г., Михайлова Ю.В., Шеленков А.А., Паневина А.В., Манзенюк И.Н., Акимкин В.Г.