ПОКАЗАТЕЛИ АЛЬФА-РАЗНООБРАЗИЯ КИШЕЧНОЙ МИКРОБИОТЫ КАК ДИАГНОСТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ КИШЕЧНИКА

Актуальность. Воспалительные заболевания кишечника (ВЗК) переживают эпидемиологический переход в России, характеризующийся неуклонным ростом заболеваемости. Характерными особенностями ВЗК в России являются поздняя диагностика и преобладание тяжелых осложненных форм с высокой летальностью. При этом современные исследования кардинально изменили представления о роли кишечной микробиоты в развитии заболеваний. Дисбиоз кишечной микробиоты признан одним

из ключевых факторов в патогенезе ВЗК, влияющим на иммунный ответ слизистой оболочки кишечника и определяющим цитоморфологические изменения на раннем этапе развития патологии.

Целью исследования. Изучить показатели альфа-разнообразия кишечной микробиоты

у пациентов с болезнью Крона (БК) и язвенным колитом (ЯК) в сравнении с показателями здоровых лиц.

Материалы и методы. В исследование были включены 230 участников: 18 пациентов

с болезнью Крона, 20 пациентов с язвенным колитом и 192 здоровых лица без ВЗК. ДНК выделены из образцов фекалий (набор SKYAmp stool DNA kit, SkyGen, Россия).

Полноразмерное секвенирование ампликонов 16S рРНК проводилось на платформе MinIon™ (Nanopore Technologies, Oxford, UK). Таксономическая идентификация последовательностей FASTQ выполнялась с помощью системы EMu путем выравнивания с базой данных NCBI 16S. Для оценки альфа-разнообразия рассчитывались индексы Chao1 и Shannon на уровне видов. Статистическая обработка данных включала двухвыборочный t-критерий Уэлча

с поп...

Кожевникова Е.О., Слепов Ю.К., Калиш С.В., Андреев Д.Н., Андреев Н.Г., Маев И.В., Лямина С.В.