Эпидемиология и Инфекционные болезни. Актуальные вопросы №4 / 2024
Характеристика штаммов Brucella melitensis, изолированных в разных регионах Российской Федерации
Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, Ставрополь, Россия
Цель исследования. Изучение фенотипических и молекулярно-генетических свойств штаммов B. melitensis, выделенных на неблагополучных по бруцеллезу территориях Российской Федерации с 1949 по 2019 г.
Материалы и методы. Использовали 74 штамма возбудителя бруцеллеза из коллекции Ставропольского противочумного института Роспотребнадзора и 3 референсных штамма (63/9, 16М и 706) из базы данных MLVA http://microbesgenotyping.i2bc.paris-saclay.fr/databases.
Результаты. Изученные штаммы B. melitensis отличались значительным разнообразием по 14 VNTR-локусам. Выявлено, что штаммы B. melitensis разделились на два крупных кластера. Один кластер образован штаммами, циркулирующими в азиатской части России, а второй кластер представлен штаммами из Европейской части России – Северо-Кавказского и Южного федеральных округов.
Заключение. Полученные данные используются для постоянного молекулярно-генетического мониторинга возбудителя бруцеллеза на неблагополучных по бруцеллезу территориях России, в том числе в качестве эффективного инструмента ретроспективного эпидемиологического анализа, что позволит качественно улучшить эпидемиологический надзор за этой инфекцией. Использование комплексных данных как фенотипического, так и генетического характера позволяет расширять возможности дифференциации штаммов во время расследования вспышек бруцеллеза в будущем.
Бруцеллез остается одной из наиболее распространенных инфекций в группе особо опасных зоонозов. Разработке и усовершенствованию методов эпидемиологической, эпизоотологической и лабораторной диагностики этого заболевания уделяется особое внимание. Ежегодно более чем в 170 странах регистрируется свыше 500 000 случаев заболевания людей. По мнению Всемирной организации здравоохранения, истинное количество заболевших ежегодно может оцениваться в 5–12,5 млн случаев. Современный бруцеллез характеризуется хроническим течением более чем в 70% случаев и инвалидизацией до 30% больных трудоспособного возраста [1]. Вряд ли можно назвать другое инфекционное заболевание, имеющее столь широкое распространение. Вышеуказанные обстоятельства определяют сохраняющуюся высокую естественную эпидемическую опасность возбудителя бруцеллеза для человека, которая в последнее время многократно усиливается реальной угрозой использования данного патогена в качестве средства биотерроризма [2].
Проблема бруцеллеза остро стоит и в Российской Федерации (РФ). В последние годы заболеваемость впервые выявленным бруцеллезом людей в РФ растет. При этом в последние 10 лет отмечается неблагополучная эпидемическая ситуация с тенденцией к снижению уровня заболеваемости людей бруцеллезом. Среднее многолетнее (2012–2021 гг.) количество случаев бруцеллеза в год составляет 327, в том числе среди детей до 17 лет – 24. Среднемноголетний интенсивный показатель заболеваемости на 100 тыс. населения составил 0,22, среди детей до 17 лет – 0,08. К регионам с наибольшей заболеваемостью людей бруцеллезом относят субъекты юга европейской части России – Северо-Кавказского федерального округа (СКФО) и Южного федерального округа (ЮФО), где ежегодно регистрируется до 70–80% случаев бруцеллеза у людей в стране [3, 4].
На долю СКФО, ЮФО и СФО приходится более 90% регистрируемых случаев. Интенсивное развитие животноводства, прежде всего крупного и мелкого рогатого скота, является одним из факторов риска, возможного осложнения эпидемиологического неблагополучия по данному заболеванию [5].
К наиболее неблагополучным по бруцеллезу регионам СКФО относят Республику Дагестан и Ставропольский край. Самые высокие показатели заболеваемости среди населения в Ставропольском крае регистрировали в районах, которые граничат с республиками Дагестан и Калмыкия. Это можно объяснить увеличением количества индивидуальных фермерских хозяйств, развитием малого и среднего бизнеса в сельскохозяйственной отрасли, активизацией миграционных процессов населения и неконтролируемым перемещением животных. Ситуацию по заболеваемости бруцеллезом в Республике Дагестан, Ставропольском крае, Республике Калмыкия можно рассматривать как индикатор неблагополучия по этой инфекции для всего европейского юга России [6]. Неустойчивая эпидемиолого-эпизоотологическая ситуация наблюдается и в СФО [7].
На практике не всегда удается установить причину вспышки бруцеллеза, его источник заражения или контаминации продуктов питания возбудителем бруцеллеза. Отягощает эпидемиологическую ситуацию низкий уровень ответственности владельцев животных за проведение профилактических мероприятий, своевременное выявление больных, сокрытие больного бруцеллезом поголовья, отсутствие должного контроля со стороны муниципальных органов за ввозом и регистрацией животных [1, 8].
Это способствует, во-первых, активизации действующих очагов инфекции и возникновению новых и, во-вторых, увеличивает возможность заражения людей при контакте с больными животными, являющимися естественным резервуаром бруцелл в природе.
Сохраняющаяся напряженная эпидемическая ситуация по бруцеллезу в РФ обусловливает необходимость дальнейшего совершенствования надзора за данной инфекцией. В настоящее время для определения молекулярной характеристики штаммов бруцелл активно используется мультилокусный анализ числа вариабельных тандемных повторов (Multiple Loci Variable Number of Tandem Repeats (VNTR) Analysis), который позволяет группировать изоляты/штаммы по временному и географическому признаку, отслеживать источники, пути передачи инфекции и их глобальное распространение [9]. Этот подход широко применяется для генетического типирования при проведении эпидемиологических исследований как на локальном, так и на глобальном уровне, а также для получения данных, которые подходят для изучения популяционной структуры и филогенетических отношений штаммов [10, 11].
Цель исследования – изучение фенотипических и молекулярно-генетических свойств штаммов B. melitensis, выделенных на неблагополучных по бруцеллезу территориях РФ с 1949 по 2019 г.
Материалы и методы
В работе использовали 74 штамма возбудителя бруцеллеза из коллекции ФКУЗ «Ставропольский противочумный институт» Роспотребнадзора и 3 референсных штамма (63/9, 16М и 706) из базы данных MLVA http://microbesgenotyping.i2bc.paris-saclay.fr/databases.
Из 74 изученных нами штаммов 73 изолята были выде...