Эпидемиология и Инфекционные болезни. Актуальные вопросы №4 / 2021
Изучение передачи лекарственной устойчивости ВИЧ-1 в Республике Армения с помощью биоинформатичских методов
1) Центральный НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва, Россия;
2) ГНО «Республиканский центр по профилактике СПИДа», Ереван, Республика Армения
Цель исследования. Анализ уровня лекарственной устойчивости (ЛУ) и структуры мутаций резистентности во фрагментах гена pol ВИЧ-1 к антиретровирусным препаратам (АРВП) среди ВИЧ-инфицированных наивных пациентов в Республике Армения; изучение особенностей передачи вариантов ВИЧ-1 и степень их генетического родства с вирусами, циркулирующими в РФ.
Материалы и методы. Выполнен анализ 546 нуклеотидных последовательностей фрагмента гена pol, выделенных от ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта приема АРТ из Республики Армения. Нуклеотидные последовательности анализировали на наличие мутаций резистентности и уровень ЛУ к АРВП с помощью базы данных Стэнфордского университета и инструмента CPR. Оценивали мутации из листа SDRM 2009 г. в соответствии со стандартными протоколами ВОЗ. Субтипы ВИЧ были определены с помощью базы Стэнфордского университета и подтверждены филогенетическим анализом.
Результаты. Уровень распространения мутаций, ассоциированных с прогностической ЛУ, составил 16,3%. Уровень передаваемой ЛУ составил 5,5%, что ВОЗ классифицирует как умеренный. Наиболее высокая ЛУ была обнаружена к 2 препаратам класса ННИОТ (NVP, EFV) и 2 препаратам класса НИОТ (FTC, 3TC). Анализ генетических вариантов ВИЧ-1 в Республике Армения и РФ показал высокую генетическую схожесть эпидемий, протекающих в этих странах.
Заключение. Выявлен рост ЛУ к АРВП с 1,5 до 5,5%. Установлен высокий (3,8%) уровень устойчивости к EFV, который назначали как препарат первой линии терапии. Важно проводить эпидемиологический надзор за распространением ЛУ в регионе в связи с увеличением охвата пациентов АРТ.
В последнее время темпы развития эпидемии ВИЧ-инфекции в мире замедлились. По оценкам ЮНЭЙДС, число новых случаев заражения ВИЧ среди взрослого населения сократилось на 40% по сравнению с 1998 г., когда этот показатель достиг максимального значения и составлял 2,8 млн чел. В 2019 г. число новых случаев заражения составило 1,7 млн [1].
Однако в то время как в мире темпы развития эпидемии снижаются, в странах бывшего Советского Союза растет распространенность ВИЧ, и число новых случаев инфекции в период с 2010 по 2019 г. увеличилось на 72%. В СССР первый случай заражения ВИЧ был зарегистрирован в 1980-х годах. Ухудшение социально-экономической ситуации и свободное безвизовое перемещение привели к массовым миграциям внутри стран Содружества Независимых Государств (СНГ). Трансграничная миграция способствовала распространению эпидемии в других странах, и в результате происходящих событий в 1988 г. был зарегистрирован первый случай заражения ВИЧ в Республике Армения [2].
К концу 2019 г. оценочное число лиц, живущих с ВИЧ (ЛЖВ), в Республике Армения составляло 3500 чел., а в Российской Федерации – 1 106 513 чел. Миграционные потоки являются важным фактором передачи инфекции: из всех ВИЧ-инфицированных в стране около 57% составляют трудовые мигранты и 13% – их половые партнеры. Таким образом, 70% случаев заражения ВИЧ в стране связаны с фактором трудовой миграции. Более 90% случаев инфицирования граждан Республики Армения, которые произошли за ее пределами, приходятся на Россию, 5% – на Украину, 0,8% – на Польшу и 0,7% – на Казахстан [3, 4]. В связи с этим эпидемии ВИЧ-инфекции в Республике Армения и Российской Федерации связаны и в значительной степени влияют друг на друга.
Основные проблемы, которые препятствуют прекращению эпидемии ВИЧ/СПИДа, – высокая распространенность ВИЧ-инфекции в связи с миграционными потоками, небрежное отношение людей к собственному здоровью, низкая приверженность антиретровирусной терапии (АРТ), отсутствие возможности тестирования на лекарственную устойчивость (ЛУ) ВИЧ в рутинном порядке.
Республика Армения в составе стран ВЕЦА (Восточная Европа и Центральная Азия) присоединилась к стратегии ЮНЭЙДС «90–90–90» для решения проблем развития резистентности к антиретровирусным препаратам (АРВП) и достижению прекращения эпидемии ВИЧ/СПИДа как угрозы общественному здравоохранению к 2030 г. Цель «90–90–90» гласит, что 90% ЛЖВ должны знать свой ВИЧ-статус, 90% людей с диагнозом ВИЧ – получать АРТ и 90% из них должны иметь неопределяемый уровень вируса в крови [5]. В 2019 г. число людей, знающих о своем ВИЧ-статусе, в Армении составило 77%, в России – 73%. Большой разрыв наблюдался между тестированием на ВИЧ и предоставляемым лечением: в России АРТ получали 50% ЛЖВ, а Армении доступ к лечению имели 63% больных ВИЧ-инфекцией. В результате в России всего у 38% ЛЖВ наблюдалось подавление вирусной нагрузки (ВН), в Армении этот показатель был выше и составил 55% [3].
АРТ широко применяется в Республике Армения, в том числе в рамках глобальной стратегии ВОЗ по борьбе с распространением ЛУ ВИЧ. По состоянию на 2017 г. АРВП в Армении предоставляются всем взрослым пациентам с ВИЧ, независимо от клинической стадии и количества CD4+-лимфоцитов. На сегодняшний день разработано обновленное клиническое руководство по профилактике и лечению ВИЧ- инфекции, основанное на рекомендациях ВОЗ 2016 г. [6]. В Армении применяются схемы терапии первого ряда на основе EFV. В качестве предпочтительных схем используют TDF + ЗTC (или FTC) + EFV; TDF + ЗTC (или FTC) + DTG. Альтернативными являются AZT + ЗTC + EFV (или NFP); TDF + ЗTC (или FTC) + EFV; TDF + ЗTC (или FTC) + NVP, при особых обстоятельствах в регионе назначают ABC или терапию , включающую ИП.
Современная АРТ существенно продлевает жизнь ЛЖВ и снижает риск передачи ВИЧ. Однако существующая высокоактивная АРТ может оказаться неэффективной в связи с выработкой вирусом мутаций ЛУ к АРВП. В России только 1% ЛЖВ проходят тестирование на определение ЛУ ВИЧ к АРВП, а Армения не имеет возможности проведения тестов на генотипирование ВИЧ, поэтому в настоящий момент в научной литературе данные о резистентности ВИЧ к АРВП в Республике Армения скудны. Известно, что в 2009–2010 гг. распространенность ЛУ среди наивных пациентов составила 1,5% [7].
С увеличением числа пациентов, принимающих АРТ, возрастает вероятность передачи резистентных форм вируса, поэтому увеличение охвата терапией влечет за собой необходимость исследования ЛУ ВИЧ-1 как у пациентов, находящихся на АРТ, так и у пациентов без опыта приема АРВП. Данные, полученные в результате анализа, необходимы, в том числе, для эпидемиологического надзора за резистентностью, так как увеличение количества используемых препаратов может ухудшить эффективность терапевтических мероприятий в стране.
В связи с этим целью исследования являлось изучение особенностей передачи лекарственно устойчивых вариантов ВИЧ-1 в Республике Армения и степень их генетического родства с вирусами, циркулирующими в...
