Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 среди пациентов без опыта антиретровирусной терапии в Северо-Кавказском федеральном округе

Цель исследования. Изучение структуры и уровня распространенности лекарственной устойчивости (ЛУ) ВИЧ-1 среди пациентов без опыта антиретровирусной терапии (АРТ), проживающих на территории Северо-Кавказского федерального округа (СКФО).
Материалы и методы. Проанализированы нуклеотидные последовательности ВИЧ-1 и сопутствующая клинико-эпидемиологическая информация от 122 ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта АРТ, проживающих на территории СКФО, полученные в период с 2010 по 2024 г. Определены мутации резистентности и прогностическая ЛУ ВИЧ-1 с использованием базы данных Стэнфордского университета HIVdb (v. 9.6). Выявлены молекулярные кластеры ВИЧ-1 с порогом генетической дистанции менее 2,0% с помощью инструмента MicrobeTrace.
Результаты. ЛУ ВИЧ-1 была обнаружена у 27,9% пациентов, наиболее часто к препаратам класса ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы (ННИОТ) – невирапину (NVP) (23,0%) и эфавирензу (EFV) (21,3%). Распространенность мутаций, значимых для надзора, составила 22,1%. В результате анализа молекулярных кластеров было установлено, что высокая распространенность ЛУ ВИЧ-1 в исследуемой выборке обусловлена передачей вариантов ВИЧ-1, содержащих мутации K103N/S, что указывает на проблему передаваемой ЛУ ВИЧ-1 в округе. При этом в результате оценки ЛУ ВИЧ-1 у эпидемиологически несвязанных лиц было показано, что распространенность первичной ЛУ ВИЧ-1 и мутаций, значимых для надзора, составила 16,5 и 9,4% соответственно.
Заключение. Продемонстрирован высокий риск распространения первичной резистентности ВИЧ-1 к ННИОТ 1-го поколения в СКФО, что требует принятия мер по предупреждению возникновения и дальнейшего распространения ЛУ-вариантов ВИЧ-1.

Проблема лекарственной устойчивости (ЛУ) ВИЧ-1 с каждым годом становится все более актуальной из-за расширения охвата пациентов антиретровирусной терапией (АРТ), применения препаратов с низким генетическим барьером к резистентности вируса, нарушения приверженности АРТ и передачи вируса, содержащего мутации резистентности.

Распространение ЛУ-вариантов ВИЧ-1 приведет к снижению клинического эффекта применяемой АРТ и к увеличению экономического бремени ВИЧ-инфекции на страну [1, 2]. В связи с этим исследования, направленные на изучение ЛУ ВИЧ-1, представляются одними из наиболее приоритетных, а тест для определения ЛУ ВИЧ-1 является одним из рутинных видов анализа, проводимых для оценки эффективности АРТ.

При этом важно также проводить анализ ЛУ ВИЧ-1 пациентам без опыта АРТ, поскольку уровень и структура первичной ЛУ ВИЧ-1 определяет эффективность схем АРТ 1-й линии. Всемирная организация здравоохранения выделяет 3 уровня распространенности первичной ЛУ ВИЧ-1: низкий (< 5%), средний (5–15%) и высокий (> 15%), при котором необходимо проводить анализ ЛУ ВИЧ-1 всем пациентам перед началом АРТ, а также исключать из схем АРТ 1-й линии препараты с низким генетическим барьером ЛУ ВИЧ-1 – невирапин (NVP) и эфавиренз (EFV).

Согласно национальным клиническим рекомендациям, тест на ЛУ ВИЧ-1 следует проводить всем пациентам перед началом АРТ, особенно в регионах с распространенностью первичной ЛУ ВИЧ-1 более 10%². В соответствии с современными стандартами первичной медико-санитарной помощи при ВИЧ-инфекции, тест на ЛУ ВИЧ рекомендуется проводить 2 раза в год 10% пациентов, включенных в стандарт медицинской помощи³. Однако на практике охват тестированием на ЛУ ВИЧ-1 низок (~1% пациентов, состоящих на диспансерном учете⁴) из-за высокой стоимости теста и недостаточной оснащенности лабораторий, проводящих секвенирование ВИЧ-1.

Несмотря на это, исследования первичной ЛУ ВИЧ-1 проводились практически во всех федеральных округах (ФО). По данным за 2019–2022 гг., распространенность первичной ЛУ ВИЧ-1 превышала 10% в Северо-Западном, Южном и Сибирском ФО, тогда как в Центральном, Дальневосточном и Приволжском ФО была ниже 5% [3]. В 2006–2022 гг. во всех ФО, кроме Приволжского (3,2%), распространенность первичной ЛУ ВИЧ-1 была на уровне или выше 5%. Кроме того, чрезвычайно высокий уровень первичной ЛУ ВИЧ-1 был описан в Северо-Кавказском ФО (СКФО), который достиг 33,3% [4]. Однако исследуемая выборка была небольшой и включала случаи внутрибольничной вспышки, что снижает достоверность.

СКФО является единственным округом в России, в котором нет лабораторий, оснащенных секвенатором для проведения теста на ЛУ ВИЧ-1. С этим же связано и отсутствие репрезентативных данных о распространенности и структуре ЛУ ВИЧ-1 в округе.

Цель исследования – изучение структуры и уровня распространенности ЛУ ВИЧ-1 среди пациентов без опыта АРТ, проживающих на территории СКФО.

Материалы и методы

Были проанализированы нуклеотидные последовательности (НП) ВИЧ-1 от 122 ВИЧ-инфицированных пациентов без опыта АРТ, проживающих на территории СКФО, полученные в период с 2010 по 2024 г. Все пациенты дали письменное информированное согласие на участие в исследовании.

НП участков, кодирующих протеазу и часть обратной транскриптазы ВИЧ-1 (2253–3369 н.п. относительно HXB2) для 122 образцов и интеграза ВИЧ-1 (4230–5093 н.п. относительно HXB2) для 32 образцов были получены с помощью набора реагентов «АмплиСенс® HIV-Resist-Seq» (ФБУН «Центральный НИИ эпидемиологии» Роспотребнадзора, Москва).

Определение ЛУ ВИЧ-1 проводили с использованием базы данных Стэнфордского университета HIVdb (v. 9.6). ЛУ-вариантами вируса считали с низким уровнем резистентности ВИЧ-1 и выше. Для оценки мутаций, значимых для надзора (surv...

>

Кириченко А.А., Киреев Д.Е., Лаповок И.А., Колпаков Д.С., Суладзе А.Г., Бекмурзиева Л.К., Гандалоев И.И., Сулейманов И.З., Муртазалиев Х.Х., Дальцаева М.К., Ртищева Л.В., Шунгарова О.А., Бобков В.Г., Бобкова М.Р., Акимкин В.Г.