Микробиологический мониторинг пациентов в инфекционном отделении реанимации

Цель исследования. Анализ данных микробной колонизации пациентов отделения анестезиологии-реанимации (ОАР) с оценкой динамики антибактериальной резистентности.
Материалы и методы. Выполнен анализ данных микробиологического мониторинга 88 пациентов с диагнозом «новая коронавирусная инфекция», поступивших в ОАР. Микробиологические исследования проводили по общепринятой методике.
Результаты. До поступления в ОАР 27,3% пациентов получали антимикробную терапию. Частота микробной колонизации различных биолокусов пациентов при поступлении в ОАР составила: содержимое нижних дыхательных путей – 93,8%, моча – 54,1%, кровь – 35,0%. В содержимом нижних дыхательных путей и моче в основном выделялись нормальные комменсалы ротовой полости и мочевыводящих путей. Отмечено значительное содержание грибов рода Candida – 24,0 и 13,6% соответственно. В крови пациентов при поступлении в ОАР в 71,4% случаев выделялись Staphylococcus spp., а в 19,0% – Аctinomyces spp. В динамике отмечено увеличение частоты выделения грибов из всех локусов пациентов. Уже при поступлении часть пациентов (7,6–38,1%) была контаминирована антибиотикорезистентными микроорганизмами, в динамике отмечалось снижение выделения антибиотикорезистентных микроорганизмов, выделенных из содержимого нижних дыхательных путей и крови.
Заключение. Микробиологический мониторинг необходим в ОАР, поскольку позволяет проводить раннюю диагностику инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, следить за динамикой эпидемического процесса и своевременно назначать рациональную антимикробную терапию.

Вопросы микробиологического мониторинга у больных инфекционными заболеваниями до начала пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19) практически не изучались. Исследования отечественных и зарубежных исследователей были посвящены корректировке известных схем лечения или разработке новых подходов к антимикробной терапии [1–3]. С началом пандемии COVID-19 и после ее окончания многочисленные исследования стали освещать развитие антибактериальной резистентности (АБР) у пациентов, находящихся в стационарах. Однако в редких работах можно отследить динамику колонизации пациентов АБР-микроорганизмами, еще меньше работ, оценивающих микробную колонизацию пациентов при поступлении [4–7]. Большинство госпитализированных пациентов с COVID-19 получали антимикробную терапию на стационарном и/или амбулаторном этапе, при этом лишь у части пациентов было подтверждено развитие вторичных бактериальных инфекций [8–10]. Нерациональное назначение антибактериальных препаратов, создающее селективное эволюционное давление на микроорганизмы, является одним из ключевых факторов формирования и широкого распространения мультирезистентных возбудителей бактериальных инфекций. Согласно временным методическим рекомендациям, в начале пандемии COVID-19 пациентам с клиническими формами коронаровирусной инфекции, протекающими с поражением нижних отделов респираторного тракта (пневмония), было показано назначение антимикробных препаратов (амоксициллин/клавулановая кислота, респираторные фторхинолоны – левофлоксацин, моксифлоксацин, цефалоспорины III и IV поколения, карбапенемы, линезолид и др.)1. Следует отметить, что в 2021 г. ВОЗ выпустила руководство, запрещающее антибактериальную терапию или профилактику у пациентов с легкой и средней степенью тяжести течения COVID-19, за исключением случаев, когда имеются клинические признаки бактериальной инфекции [11]. Тем не менее ряд авторов указывает на чрезмерное использование антибиотиков во время пандемии COVID-19 [8, 12].

Таким образом, пациенты, поступающие в стационар с COVID-19, могут быть колонизированы АБР-микроорганизмами. Под влиянием различных эндогенных и экзогенных факторов пребывания в стационаре возможна селекция микроорганизмов, обладающих АБР, и внутрибольничное их распространение, особенно среди пациентов отделений анестезиологии-реанимации (ОАР), поскольку общеизвестно, что частота бактериальных инфекций в таких отделениях выше, чем в клинических [13–15].

Цель исследования – анализ микробной колонизации пациентов ОАР с оценкой динамики АБР.

Материалы и методы

Проведено ретроспективное обсервационное описательное неконтролируемое динамическое эпидемиологическое исследование микробной колонизации различных биотопов пациентов ОАР за период апрель – июль 2020 г. многопрофильного федерального медицинского центра, перепрофилированного под оказание помощи пациентам с новой коронавирусной инфекцией.

Критерии включения:

• возраст старше 18 лет;
• диагноз COVID-19, подтвержденный положительным результатом ПЦР-исследования назофарингеального мазка на РНК SARS-CoV-2;
• госпитализация в ОАР на 7 сут и более;
• оформленное добровольное согласие пациентов на проведение лабораторных и инструментальных исследований.

Под наблюдением находились 88 пациентов с диа­гнозом новая коронавирусная инфекция тяжелой или крайне тяжелой степени, поступивших в ОАР непосредственно с амбулаторного этапа или переведенных из инфекционных отделений. Взятие биологического материала проводили с соблюдением стандартной операционной процедуры «Взятие биологического материала у пациентов для микробиологического исследования», разработанной на основании методических указаний2 в соответствии с утвержденным протоколом: свободно отхаркиваемой мокроты – при поступлении в ОАР и далее 1 раз в 7 дней; бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ) – при интубации трахеи или в первые 48 ч после интубации и далее 1 раз в 7 дней; мочи – при установке постоянного мочевого катетера и далее 1 раз в 7 дней. Микробиологическое исследование крови выполняли при наличии клинических показаний. При переводе пациента из ОАР дальнейшие микробиологические исследования биоматериала в работе не учитывали.

Взятие, хранение и транспортировку биологического материала в зависимости от его вида осуществляли в коммерческих транспортных средах: ESwab™ 480 (COPAN, Италия); BacT/Alert FA PLUS и BacT/Alert FN PLUS (bioMerieux, Франция). Посев биологического материала проводили на коммерческие плотные и жидкие питательные среды: готовые питательные среды ООО «ЦФГС», сухие питательные среды фирм bioMerieux (Франция) и Bio-Rad (...

Орлова О.А., Гусаров В.Г., Камышова Д.А., Петрова Л.В., Семененко Т.А.