Микробиота желудка и возможности пробиотиков в эрадикации H. pylori

Микробиота желудка значительно более разнообразна, чем представлялось ранее: среди представителей желудочного бактериального сообщества доминируют 5 основных типов микробов: Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria и Fusobacteria. У больных, инфицированных Helicobacter pylori, наблюдалось значительное уменьшение числа всех микробных типов, кроме Proteobacteria, особенно снижалось количество Bacteroidetes. H. pylori создает условия и определенные ниши, которые в процессе прогрессирования атрофии заполняются другими микробами. Снижение микробного разнообразия может предрасполагать к развитию рака желудка. Был прослежен постепенный сдвиг в профиле микробиоты желудка от неатрофического гастрита к кишечной метаплазии и затем к кишечному типу рака желудка. С учетом возможности безопасного и комплексного воздействия на состав микробиоты желудка, а также иммуномодулирующего действия пробиотики могут быть перспективным и многообещающим направлением терапии. Монотерапия Lactobacillus reuteri (Хелинорм) не имела достоверных различий в достижении эрадикации H. pylori по сравнению со стандартной схемой, но приводила к более значимому снижению воспалительных изменений слизистой оболочки желудка.

Желудок долгое время считался почти стерильным органом благодаря продукции соляной кислоты. Однако открытие в 1983 г. Helicobacter pylori показало, что существуют микроорганизмы, не только приспособленные к выживанию в кислой среде, но и колонизирующие именно этот отдел желудочно-кишечного тракта (ЖКТ).

H. pylori – это микроб, патогенная роль которого в развитии хронического гастрита доказана экспериментально и подтверждена тремя постулатами Коха. Несмотря на активное выявление и лечение, инфекция H. pylori остается наиболее распространенной на Земле, примерно 40% всего населения планеты инфицированы H. pylori. При этом распространенность хеликобактериоза в развитых странах существенно снизилась за прошедшие с момента его открытия 30 лет, но в некоторых развивающихся странах число инфицированных остается высоким. Риск инфицирования связан прежде всего с низким социально-экономическим статусом, скученностью проживания, пребыванием в закрытых коллективах, низким уровнем образования.

Обычно после инфицирования H. pylori становится абсолютно доминирующим микробом в желудке. Однако оказалось, что в желудке обитают и другие микроорганизмы.

Несмотря на то что рН в просвете желудка составляет 1,5–2 ЕД, покрывающий эпителий слой слизи создает градиент концентрации ионов водорода между полостью желудка и поверхностью эпителия. В пристеночных слоях слизистого слоя рН приближается к нейтральным значениям, что позволяет некоторым микробам помимо H. pylori обитать там. Гистологически в слое слизи обнаружены различные микробы [1]. У здоровых людей из желудка были изолированы и культивированы Propionibacteria, Lactobacillus, Streptococcus и Staphylococcus [2].

К сожалению, возможности бактериологического метода весьма ограничены и полная комплексная оценка микробиоты с его помощью недостижима, поскольку более 80% микроорганизмов пока не культивируемы. Появление современных молекулярно-генетических методов исследования, основанных на амплификации бактериальных 16S-rРНК генов, позволило получить более полную информацию о представителях микробного сообщества желудка. Оказалось, что микробиота желудка значительно более разнообразна, чем представлялось ранее: в нескольких современных исследованиях идентифицировано более 200 бактериальных филотипов. Несмотря на агрессивные условия среды, в желудке обнаружены представители 7–13 главных типов, свойственных и другим отделам ЖКТ, к основным из которых относятся 5: Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Fusobacteria [3].

E.M. Bik и соавт. [4] впервые исследовали 16S-rДНК последовательности в биоптатах слизистой оболочки желудка 23 взрослых пациентов, направленных на эндоскопию. Они установили, что среди представителей желудочного бактериального сообщества доминируют 5 основных типов микробов: Proteobacteria; Firmicutes; Bacteroidetes; Actinobacteria и Fusobacteria. Остальные желудочные 16S-rДНК-последовательности могут быть отнесены к Deferribacteres и Deinococcus. Тринадцать (10%) из обнаруженных в желудках бактериальных филотипов, включающих 24 клона, не были ранее описаны. Из 128 филотипов, выявленных в этом исследовании, 64 (50%) относились к ранее не культивируемым бактериям. Из них 43 (67%) были ранее обнаружены в ротовой полости людей, что подтверждает вероятность формирования микробиома желудка не как абсолютно изолированного сообщества, а как физиологически связанного с соседними органами и пополняемого при попадании содержимого в основном из вышележащих отделов ЖКТ. Среди не культивируемых ранее микробов в желудке выявлены Caulobacter, Actinobacillus, Corynebacterium, Rothia, Gemella, Leptotrichia, Porphyromonas, Capnocytophaga, TM7, Flexistipes, Deinococcus.

H. pylori в данном исследовании был единственным из рода Helicobacter и представлял собой наиболее многочисленный вид. H. pylori был обнаружен у 19 из 23 пациентов и составил 42% всей совокупности последовательностей. Только у 12 из 19 больных, у которых присутствовал H. pylori, он был диагностирован с помощью общепринятых методов. У всех 12 пациентов H. pylori доминировал среди других микробов, составив в среднем 72% всех обнаруженных клонов, в то время как у 7 пациентов, у которых H. pylori был выявлен не обычными методами, а только секвенированием, он не был доминирующим микробом и составил 11% всех бактериальных клонов. Вероятно, незначительная степень обсемененности H. pylori и стала причиной ложно(-) результатов традиционных методов диагностики H. pylori. У 4 больных, у которых H. pylori не обнаружен при секвенировании по 16S-рДНК, он также не был выявлен традиционными методами, т.е. эти пациенты были H. pylori(-). Следующими по частоте после Helicobacter родами бактерий в желудочном микробиоме были Streptococcus (299 клонов) и Prevotella (139 клонов).

Максимальное богатство видов бактерий в желудочном микробиоме было обнаружено у H. pylori-пациентов (138,8±66,3), у них же был выше индекс разнообразия микробов (индекс Shannon) – 3,1. У H. pylori-инфицированных больных отме...

Е.А. Корниенко, Н.И. Паролова